Balıkesir Üniversitesi bünyesinde yayım yapan listesi ve erişim linkleri bulunan bilimsel dergilerin makale kabulleri devam etmektedir. Çevrimiçi ve açık erişim olarak yayımlanan bilimsel dergileri:    

              Akademik Dergi Adı                                               Yayın Periyodu (Yıllık)                  Yazım Dili
1. Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2 sayı                              (Ocak-Temmuz)                   Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/baunfbed 

2. Sosyal Bilimler Enstitüsü Dergisi 2 sayı                          (Haziran-Aralık)                   Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/baunsobed 

3. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 3 sayı                          (Nisan-Ağustos-Aralık)        İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/balikesirsbd 

4. İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Dergisi 2 sayı            (Haziran-Aralık)                   Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/bauniibfd 

5. Balıkesir İlahiyat Dergisi 2 sayı                                         (Haziran-Aralık)                   Türkçe, Arapça, İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/baid 

6. NEF Elektronik Fen ve Matematik Dergisi 2 sayı             (Haziran-Aralık)                   İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/balikesirnef 

7. Karesi Mimarlık Dergisi 2 sayı                                           (Haziran-Aralık)                  Türkçe/İngilizce
https://karesiarchjournal.com.tr/?lang=tr 

8. Sosyal Aktörler ve Deneyimler Dergisi(SADED) 2 sayı   (Haziran-Aralık)                  Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/saded 

9. Balıkesir Medical Jounal Dergisi 3 sayı                             (Nisan-Ağustos-Aralık)      Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/bmedj 

10. Balıkesir Üniversitesi Hukuk Dergisi 2 Sayı                   (Haziran-Aralık)                  Türkçe/İngilizce
https://dergipark.org.tr/tr/pub/baunhd