Muş Alparslan Üniversitesi Bilimsel Dergiler Koordinatörlüğü bünyesinde yayım yapan aşağıda listesi ve erişim linkleri bulunan bilimsel dergilerin makale kabulleri devam etmektedir. 

Anemon Muş Alparslan Üniversitesi Sosyal Bilimler Dergisi (Nisan-Ağustos-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/anemon  (Sosyal Bilimler)

Din ve Bilim- Muş Alparslan Üniversitesi İslami İlimler Fakültesi Dergisi (Haziran-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/dinbil  (Dinî İlimlerle İlgili Olmak Kaydıyla Bütün Sosyal Bilim Alanları)

Hendese Teknik Bilimler ve Mühendislik Dergisi (Nisan-Ekim) https://dergipark.org.tr/tr/pub/hendese  (Mühendislik ve Fen Bilimleri)

Muş Alparslan Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi (Haziran-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/maummfd  (Mühendislik ve Mimarlık)

Bulanık MYO Sosyal Bilimler Dergisi (BULSODER) (Haziran-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/bulsoder  (Sosyal Bilimler)

Muş Alparslan Üniversitesi Eğitim Fakültesi Dergisi (MAUNEFDER) (Haziran-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/maunef  (Eğitim, Eğitim Araştırmaları, Eğitim Bilimleri ve Öğretmen Yetiştirme)

Muş Alparslan Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi (Haziran-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/msufbd  (Fen Bilimleri ve Mühendislik)

Muş Alparslan Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi (Nisan-Temmuz-Aralık) https://dergipark.org.tr/tr/pub/maunsbd  (Sağlık Hizmetleri)

Muş Alparslan Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi (Mart-Eylül) https://dergipark.org.tr/tr/pub/maujan  (Uygulamalı Bilimler)